Con la versione Smeraldo dei Pokémon si torna nuovamente ad Hoenn, quindi stesso continente, stesse città e stessi percorsi di Pokémon Rubino & Zaffiro. Anche qui, come in Cristallo, quando si incontrano Pokémon selvatici o si lotta contro allenatori, i Pokémon mentre emettono il loro verso si muovono. La grafica che, a parte le animazioni dei Pokémon all’inizio della lotta e il cambio di look dei due protagonisti, rimane identica alle due versioni precedenti, è impeccabile anche in questo gioco. Il gioco viene ampliato con il Parco Lotta, accessibile dopo aver battuto la Lega, mentre la trama coinvolge sia il Team Idro e il Team Magma, e di conseguenza entrambi i Pokémon Groudon e Kyogre. Viene infine riconfermata la modalità lotta 2 contro 2 già presente in Rubino & Zaffiro.